随着科学技术的不断进步，许多现代生物科学技术被应用于病原微生物鉴定工作中，病原微生物鉴定已从传统的形态学、血清学等病原体水平，深入到分子水平、基因组水平等，极大地提高了鉴定的准确性。在传染病防治科技重大专项支持下，“重要传染病病原鉴定关键技术研究和参比库”课题组，围绕“全面提升我国传染病的诊、防、治水平，完善国家传染病科技支撑体系”的专项目标，以传染病病原鉴定防控关键支撑技术方面需求为导向，针对我国普遍存在且多发的传染性疾病病原，近年新发突发传染性疾病病原为重点，经过三年时间的研究，新建或优化传染病病原标准化鉴定技术301项，其中新建120项，优化154项，进一步完善了我国传染病病原鉴定和保藏技术体系，填补66种传染病病原鉴定技术空白，特别是分子水平鉴定技术，提升了传染病病原鉴定发现能力，并更加清晰、准确的描述了传染病病原特征，对于提高传染病诊断水平，完善传染病防控方案具有重要支撑作用。

刘剑君，研究员，现为中国疾病预防控制中心副主任，兼任卫生部结核病专家咨询委员会委员，中国防痨协会理事长，中华医学会结核病学分会常务理事。主持多项科技部研究和国际合作项目；有关循证医学和疾病控制策略的文章在国内外杂志发表，其中“Analysis on factors affecting the epidemic situation of tuberculosis in China”于2005年4月发表在《The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease》，“Progress of DOTS in global tuberculosis control”于2006年3月发表在《Lancet》。

前　言 近年来，新发、突发传染性疾病不断出现，快速准确鉴定传染病病原体对疫情防控和病原微生物资源保藏工作尤为重要。我国短时间内成功分离、鉴定新型冠状病毒，并积极开展国家保藏与共享，为迅速启动联合科研攻关，研发相关诊断试剂、疫苗、动物模型等国家重大需求作出了重要贡献。 随着科学技术的日益进步和不断发展，越来越多的新的生物技术被应用于传染病病原体鉴定工作之中，传染病病原体鉴定已从以往的分离培养、形态学和血清学水平，进入了聚合酶链反应、核酸分子杂交和基因组测序等核酸和分子水平，极大地提高了鉴定工作的准确性和时效性。在“十三五”传染病防治科技重大专项支持下，“重要传染病病原标准化鉴定关键技术研究和参比库建立”（2018ZX10734404）课题组围绕“全面提升我国传染病的诊、防、治水平，完善国家传染病科技支撑体系”的专项目标，以传染病病原体鉴定关键支撑技术建立需求为导向，针对我国以往普遍存在且多发的传染性疾病，以及近年新发、突发传染性疾病为重点，经过３年左右的时间，初步研究建立了一套适用于重要传染病病原体保藏工作所需的标准化鉴定技术方法体系。 2021年4月15日正式实施的《中华人民共和国生物安全法》提出了加强我国生物安全基础能力建设，提升我国生物安全防范水平的明确要求。作为国家生物安全工作的重要组成部分，研究、丰富重要传染病病原体鉴定技术方法，进一步完善我国传染病病原体鉴定技术方法体系，是落实《中华人民共和国生物安全法》的重要体现。因此，为将上述课题成果应用于国家生物安全工作之中，更好地支撑传染病防控和病原微生物资源保藏工作需要，中国疾病预防控制中心组织...