史玉升获中国十大科技进展1项（排1）、国家发明二等奖1项（排1）、国家科技进步二等奖2项（排1和3）、省部级一等5项、省部级二等奖6项，获十佳全国优秀科技工作者提名奖、武汉市科技重大贡献奖等称号。